Чистка шаблонов нужна просто для того что бы на страницы доров не подтягивалась информация со сторонних ресурсов, через разные скрипты и ссылки + ПС (поисковые системы) распознают паттерны вебмастера, серверов и вычисляют сетки сайтов (доров). Часто шаблоны подтягивают дизайн или элементы дизайна со сторонних ресурсов - конструкторы и т.д. Для очистки, нужно оставить только скелет сайта, саму суть. Так же на шаблонах из открытых источников могут навесить своих ссылок, скриптов и ты будешь терять трафик, или же эти ссылки будут забанены ПС и в следствии и сам сайт как ссылающийся на запрещённый. + шаблоны могут быть просто помечены одним автором (авторская подпись или ещё что-нить х.з. что там взбредёт автору в голову) что тоже выдаёт сетку.
Макросы это просто кодовое слово для доргена. Каждое кодовое слово заставляет выполнить определённое действие дорген. Задача, чтобы на выходе получился сайт, страничка сайта так, как будто ты вручную верстаешь сайт, страничку сайта. Это легко выполнить если знать SEO и вёрстку, ну или просто посмотреть как это выполнено на нормальных сайтах "конкурентов". Т.е. макросы нужно раставить так чтоб получился сайт после обработки доргеном. Ну и соответственно все макросы НЕ нужно засовывать в один шаблон. Вместо заголовка на норм сайте нужно поставить макрос, тот каторый тебе больше нравиться из подходящих (смотреть инструкции к доргенам), или же ты считаешь нужным из соображений вёрстки и seo.
Мануалы есть, просто они присутствуют только в тематических чатах и на сайтах, каждого отдельного доргена. Т.к. просто выкидывать кудато на просторы общественного интернета нет смысла, во первых ни кому не нужны конкуренты, во вторых мануалы не принесут пользу тем кто не знает даже, что такое дор, или кто не пользуется этим или другим доргеном.
Каким доргеном пользуешься или планируешь пользоваться?
Почитай, не инструкция но определённые выводы сделать можно: Шаблоны для доров
Надежные мобильные и резидентные прокси для вашего бизнеса! 
США, 
Франции, 
Ирландии, 
Молдовы, 
Испании, 
Англии, 
Польши, 
Болгарии, 
Литвы, 
Индонезии, 
Индии, 
Украины, 
Казахстана, 
Кыргызстана, 
Таиланда, 
Турции, 
России и тд.
